Dat heeft minister Eberhard van der Laan (Integratie) dinsdag geschreven aan de Tweede Kamer.
In Den Haag stelde de GGD al vast dat kinderen stelselmatig klappen krijgen tijdens de lessen.
Het kabinet maakt zich zorgen over de berichten van kindermishandeling die opduiken.
Het Verwey-Jonker Instituut is al bezig met een onderzoek naar de manier waarop er les wordt gegeven op de moskeeen, maar de GGD zal zich nu speciaal gaan richten op mishandeling.
Weigerachtig
Moskeeen in Tilburg en Amsterdam weigeren mee te werken aan het onderzoek van het Verwey-Jonker Instituut.
Deelname is niet verplicht, maar Van der Laan vindt het onwenselijk dat de moskeeën zich zo weigerachtig opstellen.
Hij heeft de besturen van de betrokken moskeeën uitgenodigd voor een gesprek op het ministerie, aldus nu.nl.